Table 1 A summary of the four sequence changes (SC) detected in different surface fish and cavefish populations
SC1 | SC2 | SC3 | SC4 | |
|---|---|---|---|---|
SF Texas | C– – ––––––––CACACACACACACACACA - A - G | – | G–AAGCCCCCTTCCCCCCCTCCCCCCCC–TGCCT–C–T | ATAAAAA |
SF Mexico | CCACACACACACACACACACACACACACA–A–G | + | G–AAGCCCCCCTT–––––––CCCCCCCC–TGCCTTC–T | A– – – – A |
CF Pachón | C– – ––––––––CACACACACACA– – –––––A–G | + | G–AAGCCCCCCTCCCTCC––CCCCCCCC–TGCCT–C–T | A– – – – A |
CF Molino | C– – ––––––––CACACACACACA– – –––––A–G | + | GGAAGCCCC–––CCCTCC––CCCCCCCCCTTGCTT––T | A– – – – A |
CF Jineo | CCA– ––––––– CACACACACACACACACA - A - G | + | G–AAGCCCCCCTCCC–CC––CCCCCCT––TGC–TT––T | A– – – – A |
CF Chica | ND | + | GGAAGCCCCCCT–––T–C––CCCCCCCC–TGCCTTCCT | A– – – – A |
CF Los Sabinos | C– – –––––––– CACACACACACACACACA - A - G | + | GGAAGCCCCCCT–––TC–––CCCCCCCC–TGCCTTC–T | A– – – – A |
CF Tinaja | C– – ––––––––– –CACACACACACACACACAAG | + | ND | A– – – – A |