Skip to main content

Table 1 Primer sequences for various genes

From: The phenotypic plasticity of developmental modules

Gene

dsRNA preparation primer sequence

 

arm1

FW: 5′-AAGATGGTCTCCTTGCTTCA-3′

 

RV: 5′-AATCGCTGGTTTGTTGCTC-3′

 

arm2

FW: 5′-AGTAAAATGGCTGTGCGTGT-3′

 

RV: 5′-CCCTGAGAGGCAAGAATGA-3′

 

abd-A

FW: 5′-AGGGCGGTGAAGGAGATAA-3′

 

RV: 5′-TCTGGTGGTGCTGTTGGT-3′

 

Abd-B

FW: 5′-GCCAACAACAACAACAGCA-3′

 

RV: 5′-GGTGTTTCATGGCTCCAC-3′

 

Ddc

FW: 5′-CACAGAGCTGGAAGTGGTGA-3′

 

RV: 5′-CCATTCTGGGTGTTCTGCTT-3′

 

Gene

Knock down verification primer sequence

# of cycles used

arm1

FW: 5′-AGTCCGTGCTGTTCTACGC-3′

35

RV: 5′-AGGGTCCAGAGGCAGTTCT-3′

 

arm2

FW: 5′-TCATCGTCAAGGGTTGCT-3′

30

RV: 5′-TCTGAACTAATCGCTGTGAAGG-3′

 

abd-A

FW: 5′-CGGCTCAGTTCTACCACCA-3′

33

RV: 5′-TTCTGGGGCTGTTCCATT-3′

 

Abd-B

FW: 5′-GAGTTCCTCTTCAACGCCTAC-3′

33

RV: 5′-CTGCGGTTTTGGTTCTTCT-3′

 

Ddc

FW: 5′-TCCCGACAGCAAACTCCT-3′

37

RV: 5′-TTCAGGTAGAGAGGGTCAACA-3′

 

rps3

FW: 5′-TTGATACCCAAAACCCCTTG-3′

23/25/27

RV: 5′-CAACCCCATACACTTGACCT-3′

Â