Table 1 Primer sequences for various genes
| Gene | dsRNA preparation primer sequence | |
|---|---|---|
| arm1 | FW: 5′-AAGATGGTCTCCTTGCTTCA-3′ | |
| RV: 5′-AATCGCTGGTTTGTTGCTC-3′ | ||
| arm2 | FW: 5′-AGTAAAATGGCTGTGCGTGT-3′ | |
| RV: 5′-CCCTGAGAGGCAAGAATGA-3′ | ||
| abd-A | FW: 5′-AGGGCGGTGAAGGAGATAA-3′ | |
| RV: 5′-TCTGGTGGTGCTGTTGGT-3′ | ||
| Abd-B | FW: 5′-GCCAACAACAACAACAGCA-3′ | |
| RV: 5′-GGTGTTTCATGGCTCCAC-3′ | ||
| Ddc | FW: 5′-CACAGAGCTGGAAGTGGTGA-3′ | |
| RV: 5′-CCATTCTGGGTGTTCTGCTT-3′ |
| Gene | Knock down verification primer sequence | # of cycles used |
|---|---|---|
| arm1 | FW: 5′-AGTCCGTGCTGTTCTACGC-3′ | 35 |
| RV: 5′-AGGGTCCAGAGGCAGTTCT-3′ | ||
| arm2 | FW: 5′-TCATCGTCAAGGGTTGCT-3′ | 30 |
| RV: 5′-TCTGAACTAATCGCTGTGAAGG-3′ | ||
| abd-A | FW: 5′-CGGCTCAGTTCTACCACCA-3′ | 33 |
| RV: 5′-TTCTGGGGCTGTTCCATT-3′ | ||
| Abd-B | FW: 5′-GAGTTCCTCTTCAACGCCTAC-3′ | 33 |
| RV: 5′-CTGCGGTTTTGGTTCTTCT-3′ | ||
| Ddc | FW: 5′-TCCCGACAGCAAACTCCT-3′ | 37 |
| RV: 5′-TTCAGGTAGAGAGGGTCAACA-3′ | ||
| rps3 | FW: 5′-TTGATACCCAAAACCCCTTG-3′ | 23/25/27 |
| RV: 5′-CAACCCCATACACTTGACCT-3′ |